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Conservation et stockage des factures électroniques : obligations légales, valeur probante et conformité 2026

Conservation et archivage facture électronique

Dans le cadre de la réforme de la facturation électronique prévue à partir du 1er septembre 2026, toutes les entreprises devront émettre et recevoir des factures électroniques. Cette évolution réglementaire renforce les exigences en matière de conservation et d’archivage.

 

Tous ces éléments contribuent à garantir les trois principes essentiels tout au long du processus, depuis la création de la facture électronique jusqu’à la fin de sa période de conservation.

 

Pourquoi la conservation des factures électroniques est-elle obligatoire ?

 

La conservation des factures électroniques constitue une obligation légale encadrée par le Code général des impôts (article 289-VII) et le Code de commerce.

 

Toute entreprise doit garantir :

 

  • L’authenticité de l’origine
  • L’intégrité du contenu
  • La lisibilité de la facture

 

Ces obligations s’inscrivent dans une logique complète de maîtrise du système documentaire, allant de l’émission à la restitution en cas de contrôle fiscal.

La conservation n’est donc pas une simple sauvegarde informatique : elle s’intègre dans une chaîne globale de conformité.

 

La chaîne de conformité d’une facture électronique

 

Schéma conformité facture électronique article 289-VII CGI piste d’audit conservation restitution

 

La conformité d’une facture électronique repose sur plusieurs étapes successives :

 

  1. Acceptation du destinataire
  2. Contrôle des factures
  3. Piste d’audit fiable
  4. Conservation
  5. Restitution en cas de contrôle

 

Chaque étape contribue à garantir la sécurité juridique du document.

 

Le contrôle des factures (Article 289-VII du CGI)

 

La réglementation fiscale prévoit trois modalités permettant de garantir l’authenticité et l’intégrité :

 

    • EDI complet (3° du CGI) : L’EDI est un fichier structuré répondant aux normes prévues par le Code général des impôts. Chaque donnée peut être identifiée automatiquement et de façon univoque. L’utilisation de l’EDI complet nécessite la mise en place d’une liste des partenaires et d’une liste récapitulative comme spécifiée dans le CGI Annexe IV – Article 41 septies.

 

    • Signature électronique qualifiée (2° du CGI) : Il s’agit d’un dispositif sécurisé de création de signature ou de cachet électronique qualifiée au sens du règlement (UE) n° 910/2014 du Parlement européen et du Conseil du 23 juillet 2014 sur l’identification électronique et les services de confiance pour les transactions électroniques au sein du marché intérieur.

 

    • Autres contrôles documentés via une piste d’audit fiable (1° du CGI) : Elle doit permettre de reconstituer la totalité du processus de facturation en mettant en place des contrôles permanents et documentés depuis son origine jusqu’au document final.

 

Ces dispositifs doivent être formalisés, documentés et intégrés dans l’organisation de l’entreprise.

 

👉 La conservation intervient ensuite pour sécuriser juridiquement l’ensemble du processus.

 

Quelle est la durée légale de conservation d’une facture électronique ?

 

La durée dépend du cadre juridique applicable.

 

Obligation fiscale : 6 ans

 

Selon l’article L102 B du Livre des Procédures Fiscales, les factures doivent être conservées pendant 6 ans.

 

Il est à noter que si l’assujetti a choisi la Piste d’Audit Fiable comme voie de sécurisation, ces obligations valent également pour les informations, documents, données, traitements informatiques mis en œuvre.

 

Obligation commerciale : 10 ans

 

Le Code de commerce impose une conservation des documents comptables pendant 10 ans.

 

👉 En pratique, les entreprises retiennent une durée de 10 ans.

 

Tableau récapitulatif

 

Fondement juridique Durée
Obligation fiscale 6 ans
Obligation commerciale 10 ans
Bonne pratique recommandée 10 ans

 

Stockage ou archivage : quelle différence ?

 

Le simple stockage d’un PDF ne garantit pas la conformité.

 

Stockage simple

 

  • Fichier enregistré sur un serveur
  • Sauvegarde informatique
  • Absence de garantie d’intégrité formelle

 

Archivage électronique à valeur probante

 

L’archivage doit garantir :

 

  • Intégrité du document
  • Horodatage
  • Traçabilité des accès
  • Sécurisation contre toute modification
  • Capacité de restitution fidèle

 

Stockage Archivage probant
Sauvegarde technique Sécurité juridique
Pas forcément tracé Traçabilité complète
Non opposable Opposable en cas de contrôle

 

Comment garantir la valeur probante d’une facture électronique ?

 

La valeur probante repose sur trois piliers :

 

Intégrité

 

La facture ne doit pas pouvoir être modifiée après émission.

 

Cela implique :

 

  • Scellement électronique
  • Empreinte numérique
  • Contrôles internes documentés

 

Lisibilité

 

La facture doit rester accessible et exploitable pendant toute la durée de conservation, indépendamment des évolutions technologiques.

 

Traçabilité

 

Chaque action doit être enregistrée :

  • Consultation
  • Modification
  • Transmission
  • Suppression éventuelle

 

Documentation et maîtrise du système

 

La réglementation insiste sur la documentation du système d’archivage.

 

L’entreprise doit être capable de démontrer :

 

  • Son organisation interne
  • Ses procédures de contrôle
  • Ses règles de conservation
  • Ses mesures de sécurité

 

La documentation constitue un élément central en cas de contrôle fiscal.

 

Conservation et réforme de la facturation électronique 2026

 

À partir de 2026, toutes les entreprises devront émettre et recevoir des factures électroniques via des Plateformes Agréées / PA (ex-PDP : Plateforme de Dématérialisation Partenaire).

 

La conservation reste une responsabilité de l’entreprise

 

Même si une PA assure la transmission :

 

  • L’entreprise reste responsable de la conservation légale
  • Elle doit garantir la disponibilité des factures
  • Elle doit assurer la restitution en cas de contrôle

 

Conservation des données de e-reporting

 

Les données transmises à l’administration (transactions, paiements) doivent également être conservées dans un environnement sécurisé.

 

👉 Pour en savoir plus sur l’e-reporting, consulter notre article

 

Quels sont les risques en cas de mauvaise conservation ?

 

Une conservation non conforme peut entraîner :

 

  • Rejet de la TVA déductible
  • Redressement fiscal
  • Amende administrative
  • Perte de valeur probante
  • Risque en cas de contentieux

 

La conservation des factures électroniques constitue donc un enjeu stratégique pour la sécurité financière de l’entreprise.

 

Sécurité des données

 

Les factures contiennent des données sensibles :

 

  • Données financières
  • Données personnelles
  • Informations contractuelles

 

Le système d’archivage doit garantir :

 

  • Hébergement sécurisé (France / UE recommandé)
  • Protection contre les cyberattaques
  • Sauvegarde externalisée
  • Conformité RGPD

 

Un système certifié ISO 27001 renforce la protection des données.

 

Checklist : êtes-vous conforme ?

 

✔ Durée de conservation définie
✔ Archivage sécurisé
✔ Garantie d’intégrité
✔ Procédure documentée
✔ Traçabilité assurée
✔ Capacité de restitution immédiate
✔ Sécurité informatique conforme

 

 

FAQ – Conservation des factures électroniques

Combien de temps faut-il conserver une facture électronique ?

Un simple PDF suffit-il pour être conforme ?

Peut-on stocker ses factures sur un serveur interne ?

La PA conserve-t-elle les factures ?

L’archivage électronique est-il obligatoire ?